1950年，我人民解放军进军昌都并取得了胜利，中国共产党的统一战线政策也广为传布，这使西藏的爱国力量昂扬起来。同年冬天，亲帝的达札摄政被迫下台，第十四世达赖喇嘛亲政。他派人到昌都与中共联系，还派人到我驻印大使馆，表示愿派人谈判。

    早在1949年10月1日，避居香日德的十世班禅就致电毛泽东与朱德，电文中说“兹幸在钧座领导之下，西北已获解放，中央人民政府成立，凡有血气，同声鼓舞。今后人民之康乐可期，国家之复兴有望。……班禅谨代表全藏人民，向钧座致崇高无上之敬意，并矢拥护爱戴之忱。”1950年9月，其主要官员计晋美率领的致敬团到达北京，并将《解放西藏的办法及政府组织方案》，呈递给毛泽东。

    针对上述情况，在很快发出的两份电报中，中共中央肯定“班禅代表所提方案很好，合乎爱国和团结的精神。”电文指出：“班禅集团愿意同我们合作，是一个很好的事情。不管西藏解放的形式如何及达赖集团的变化如何，我们必须积极争取班禅集团，和他们所影响的人民合作。”电文还说：“班禅回西藏是肯定了的，回西藏的时机亦俟以后看情况决定。”

    1951年4月下旬，西藏地方政府代表团到达北京，与中央人民政府的代表开始谈判。谈判中，他们将排斥班禅作为五项条件之一，主张另立协议。中央代表严正指出，“班禅问题不能从协议中去掉。因为中央人民政府成立，班禅先通电拥护，他们三十年来没有勾结帝国主义，没有出国，这是个界限。”经过充分友好协商，5月23日，《中央人民政府和西藏地方政府关于和平解放西藏办法的协议》在京签字。《协议》指出：“班禅额尔德尼的固有地位及职权，应予维持”，“达赖喇嘛及班禅额尔德尼之间的固有地位及职权，系指十三世达赖喇嘛与九世班禅额尔德尼彼此和好相处时的地位及职权。” 

    5月24日晚，毛泽东主席举行盛大宴会庆祝协议签字，周恩来、朱德、刘少奇等在京党和国家领导人几乎全部出席。毛泽东发表了重要讲话，他说：“几百年来，中国各民族之间是不团结的，特别是汉民族与西藏民族之间是不团结的，西藏民族内部也不团结。……现在，达赖喇嘛领导的力量与班禅额尔德尼所领导的力量与中央人民政府之间，都团结起来了。这是中国人民打倒了帝国主义及国内反动统治之后才达到的。这种团结是兄弟般的团结，不是一方面压迫另一方面。这种团结是各方面共同努力的结果。今后，在这一团结基础上，我们各民族之间，将在各方面，将在政治、经济、文化等一切方面，得到发展和进步。”

    5月30日，十世班禅致电十四世达赖喇嘛庆贺协议签字，电文中说，“班禅愿竭绵薄，精诚团结，在中央人民政府和毛主席的英明领导下，协助您和西藏地方政府，彻底实行协议，为和平解放西藏而奋斗。”四个半月后，达赖发电班禅，终于承认了班禅正身，并说“现在希望即速启程回来。”

    1952年4月28日，班禅额尔德尼安全返抵拉萨，中央驻藏代表、人民解放军官兵、西藏地方政府官员和西藏地方政府部队，三大寺僧众和拉萨市民举行了热烈的欢迎仪式。当天下午，班禅前往布达拉宫拜会达赖，从而结束了长达29年的两大活佛系统失和的历史!   

    班禅额尔德尼·确吉坚赞曾热情洋溢地说：“中央人民政府、达赖和班禅三方面的团结，只有在中国共产党和人民政府领导下才能实现。”